
人类基因组中约 98.5% 的序列为非编码 DNA,其转录产物非编码 RNA(ncRNA)曾被误认为是“垃圾RNA”。随着分子生物学技术的快速发展,现已证实ncRNA是基因表达调控的关键“指挥者”,不编码蛋白质但通过多样化机制参与细胞增殖、分化、凋亡等几乎所有生命活动。根据长度与结构特征,ncRNA主要分为微小RNA(miRNA,20-24 nt)、长链非编码RNA(lncRNA,>200nt)、环状RNA(circRNA)、PIWI互作RNA(piRNA)等类别。
ncRNA 的调控机制具有多样性与复杂性:miRNA 通过结合 mRNA 的 3'UTR 区介导靶基因降解或翻译抑制;lncRNA 可作为分子海绵吸附 miRNA、招募染色质修饰复合物调控转录;circRNA 以共价闭合环状结构稳定存在,参与转录后调控及信号通路激活。解析上述调控机制,需获取高纯度、高完整性、无基因组 DNA 污染的 ncRNA 样本,而传统手工提取方法存在操作繁琐、重复性差、小片段 RNA 回收率低、易引入污染等缺陷,难以满足规模化、精准化研究需求。
核酸提取仪的出现解决了这一技术瓶颈。博清生物科技(南京)有限公司研发的BHT-16T核酸提取仪是一款专为科研场景设计的自动化设备,采用磁珠法分离技术,适配多类型样本,可高效完成 ncRNA 的提取与纯化。
一、非编码 RNA 调控机制研究的样本制备核心需求
ncRNA 自身的结构特性与调控机制研究的技术要求,决定了样本制备需满足以下核心条件,这也是核酸提取设备选型的关键标准。
(一)高完整性与高回收率,适配不同长度 ncRNA
ncRNA涵盖20nt左右的miRNA至数千nt的lncRNA,其中miRNA等小片段RNA易在提取过程中流失,而lncRNA等长片段 RNA 易降解。研究需同时回收不同长度的 ncRNA,且RNA完整性数(RIN值)需>7.0,才能保障后续qRT-PCR、RNA-seq等实验的准确性。传统手工提取对小片段RNA回收率不足50%,而优质自动化提取设备需将回收率提升至85%以上。
(二)高纯度,无基因组 DNA 与蛋白污染
ncRNA调控机制研究(如lncRNA转录调控验证、miRNA靶基因鉴定)对RNA纯度要求极高。基因组DNA污染会导致qRT-PCR假阳性,蛋白、多糖等杂质会抑制逆转录酶、聚合酶活性,干扰下游酶促反应。合格的ncRNA样本需满足OD260/280=1.8-2.0,OD260/230>2.0,且无明显DNA条带。
(三)批次稳定性与低污染风险,适配规模化研究
ncRNA调控机制研究常需批量处理数十份样本(如不同组织、不同处理组样本),要求提取设备具备批次间一致性(孔间提纯差异 CV≤5%),避免样本间交叉污染。同时,自动化操作可减少人工接触有毒试剂(如苯酚、氯仿),提升实验安全性。
(四)样本兼容性广,适配复杂生物样本
ncRNA可来源于细胞、组织、全血、血浆、外泌体、病毒等多种样本,其中组织样本(如肌肉、脑组织)富含纤维或脂肪,外泌体样本 ncRNA 含量极低,均对提取设备的裂解效率与富集能力提出更高要求。
二、博清生物 BHT-16T 核酸提取仪的技术原理与性能优势
(一)核心技术原理
BHT-16T 核酸提取仪采用磁珠吸附分离技术,结合自动化机械臂与精准温控系统,全程替代手工操作,完成样本裂解、核酸吸附、杂质洗涤、目标核酸洗脱全流程。其核心原理为:
1、裂解:加热模块精准控温(室温- 120℃),配合裂解液与蛋白酶 K,高效裂解细胞/组织,释放 ncRNA;
2、吸附:磁珠表面修饰特异性基团,在高盐环境下与 ncRNA 特异性结合,形成磁珠 - ncRNA 复合物;
3、洗涤:多档可调振荡混合(1-10档),去除蛋白、多糖、基因组DNA等杂质;
4、洗脱:低盐、高pH环境下,ncRNA与磁珠解离,获得高纯度ncRNA溶液,可直接用于下游实验。
(二)关键性能优势
BHT-16T核酸提取仪针对ncRNA研究需求设计,核心性能参数与优势如下:
1、高效适配ncRNA提取,回收率与完整性双优
专属ncRNA提取程序:配套博清生物磁珠法ncRNA提取试剂盒,优化磁珠配比与洗脱条件,miRNA 回收率≥90%,lncRNA完整性保留率≥85%,可同步富集miRNA、lncRNA、circRNA 等全类型 ncRNA;
精准温控系统:裂解温度精度±0.5℃,避免高温导致 lncRNA 降解;洗脱温度精准控制,保障小片段RNA高效洗脱;
多档振荡混合:适配不同样本裂解需求,纤维组织、脂肪组织等难裂解样本也可实现充分裂解,减少ncRNA损失。
2、高纯度提取,有效去除杂质污染
内置DNase消化模块:提取过程中可同步去除基因组DNA,无需额外操作,彻底避免DNA污染;
多重洗涤程序:优化洗涤液配方,高效去除蛋白、多糖、脂类等杂质,提取的 ncRNA 样本 OD260/280 稳定在 1.8-2.0,满足下游实验要求;
HEPA 过滤 + 紫外消毒系统:内置 HEPA 过滤装置与可定时紫外消毒模块,有效抑制气溶胶交叉污染,保障样本安全性。
3、自动化与便携性兼具,适配科研场景
自动化操作:5 寸触摸屏可视化操作,支持自定义程序与存储 500 组常用程序,单次可处理 1-16 个样本,快提模式 15-22 分钟/批,通用模式 30-50 分钟/批,大幅提升实验效率;
小巧便携:设备体积小、节省实验室空间,开机自检、过温保护等人性化设计,适配普通分子生物学实验室使用;
开放适配性:兼容全血、组织、细胞、病毒、外泌体等多源性样本,可灵活搭配不同品牌磁珠法试剂盒,降低实验成本。
4、批次稳定性强,保障数据可靠性
优质磁路设计:采用一体式磁棒,磁性稳定,磁珠损耗低,批次间提取效率一致,孔间提纯差异 CV≤5%,确保多样本实验数据可比性;
低噪防振结构:独立丝杆设计,运行稳定,避免机械振动导致样本交叉污染或 ncRNA 降解长沙政府采购网。
三、BHT-16T 核酸提取仪在 ncRNA 调控机制研究中的应用
(一)多类型样本 ncRNA 的高效制备
ncRNA 调控机制研究需从不同样本中提取 ncRNA,以分析其表达模式与功能。BHT-16T 核酸提取仪可适配多种样本:
1、细胞样本:培养细胞经裂解后,可高效提取总 RNA(含 miRNA、lncRNA),用于细胞水平 ncRNA 表达谱分析;
2、组织样本:肝、脑、肿瘤组织等,经机械破碎后,利用 BHT-16T 的精准温控与高效裂解能力,提取完整 ncRNA,用于组织特异性 ncRNA 调控机制研究;
3、体液与外泌体:全血、血浆、血清及细胞上清外泌体,ncRNA 含量低,BHT-16T 的高灵敏度磁珠富集技术可高效回收微量 ncRNA,适用于循环 ncRNA 的调控功能研究;
4、病毒与微生物:病毒颗粒、细菌等样本,可提取其编码的 ncRNA,解析病原体与宿主间的 ncRNA 介导的调控机制。
(二)支撑 ncRNA 表达谱与多组学分析
高通量 RNA-seq 与 qRT-PCR 是 ncRNA 表达模式分析的核心技术,而高质量 ncRNA 样本是实验成功的关键。
1、RNA-seq 文库构建:BHT-16T 提取的 ncRNA 完整性高、杂质少,可直接用于链特异性 RNA-seq 文库构建,全面捕获 miRNA、lncRNA、circRNA 的表达信息,筛选差异表达 ncRNA,为调控机制研究提供靶点;
2、qRT-PCR 定量验证:提取的 ncRNA 无 DNA 污染,逆转录效率高,可精准定量特定 ncRNA(如 miR-21、lncRNA HOTAIR)的表达水平,验证 RNA-seq 结果的可靠性;
3、多组学整合研究:结合蛋白质组学、表观基因组学,BHT-16T 提供的高质量 ncRNA 样本可支撑 ncRNA - 蛋白质互作、ncRNA 介导的染色质修饰等多组学分析,系统解析 ncRNA 调控网络。
(三)助力 ncRNA 功能验证与机制解析
ncRNA 调控机制的验证需通过过表达、敲低、靶基因验证等实验,而稳定的 ncRNA 样本制备是实验重复性的保障。
1、过表达/敲低实验:BHT-16T 可批量提取转染后细胞的 ncRNA,精准检测目标 ncRNA 的表达变化,验证过表达/敲低效率,为后续功能实验提供基础;
2、靶基因验证:通过双荧光素酶报告实验验证 miRNA 与 mRNA 的靶向关系,或通过 RNA 免疫沉淀(RIP)实验验证 lncRNA 与蛋白质的互作,BHT-16T 提取的 ncRNA 纯度高,可减少非特异性结合,提升实验准确性;
3、疾病相关机制研究:在肿瘤、神经退行性疾病等研究中,BHT-16T可从临床组织样本中提取ncRNA,分析疾病特异性 ncRNA 的表达异常,结合功能实验解析其在疾病发生发展中的调控机制,为疾病诊断与治疗提供潜在靶点。
非编码RNA调控机制是分子生物学领域的研究热点,而高质量 ncRNA 样本制备是研究的核心前提。博清生物科技(南京)有限公司研发的BHT-16T核酸提取仪凭借磁珠法自动化提取技术、高回收率与高纯度、多样本兼容、批次稳定、安全便捷等优势,精准匹配ncRNA调控机制研究的核心需求,可高效支撑 ncRNA 表达谱分析、功能验证、多组学整合等全流程研究,为分子生物学实验室提供了一款经济、高效、可靠的ncRNA样本制备设备。





