荧光计在生物分子相互作用检测中的应用研究

Dec,22,2025 << Return list

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蛋白与小分子(如药物分子、代谢物)、蛋白与核酸(DNA/RNA)的相互作用广泛参与基因表达调控、信号传导、物质运输等关键生命过程。精准获取生物分子相互作用的亲和力参数(如结合常数、解离常数)、结合模式等信息,是解析生命活动机制、开展药物靶点筛选与验证的核心前提。目前,检测生物分子相互作用的技术主要包括凝胶阻滞实验(EMSA)、酶联免疫吸附试验(ELISA)、微量热泳动(MST)及荧光光谱法等。其中,荧光光谱法因具有灵敏度高、样品用量少、操作简便、可实时监测等优势,成为生物分子相互作用研究的常用技术手段。

博清生物科技(南京)有限公司研发的荧光计作为一款紧凑型微量检测设备,具备1-20μL微量样品检测能力,其集成化光路设计可兼容多种荧光染料与探针,配合精准的控温系统和智能分析软件,为荧光检测实验提供了稳定可靠的平台。本研究旨在系统验证博清生物荧光计在蛋白-小分子及蛋白-核酸相互作用检测中的适用性,建立标准化的实验方法,为该仪器在生命科学研究领域的推广应用提供实验依据。

一、材料与方法

(一)实验材料

牛血清白蛋白(BSA,纯度≥98%)、芦丁(纯度≥98%)、NLRP6蛋白(重组表达纯化)、dsRNA(人工合成,长度50bp)、FAM荧光标记dsRNA探针、Tris-HCl缓冲液(0.05 M,pH 7.4)、DMSO(色谱纯);实验用水为超纯水(电阻率≥18.2MΩ·cm)。

实验仪器为博清生物荧光计,支持2通道荧光检测;石英比色皿(光程1cm);微量移液器(1-10μL、10-100μL);恒温培养箱。

(二)实验方法

1、蛋白-小分子相互作用检测(BSA-芦丁体系)

溶液配制:用Tris-HCl缓冲液(pH 7.4)配制3.0×10⁻⁶mol·L¹的BSA溶液和3.75×10⁻⁴mol·L¹的芦丁储备液(含5% DMSO,DMSO终浓度≤0.5%,避免影响蛋白构象)。

荧光滴定实验:移取2.5mL BSA溶液至石英比色皿中,置于博清生物荧光计样品台,设定激发波长280nm,激发/发射狭缝宽度均为5.0nm,扫描速度500nm·min¹,扫描290-400nm范围内的荧光发射光谱,记录空白荧光强度F。随后,用微量注射器逐次加入芦丁储备液,每次加入后混匀,室温孵育10min,在相同参数下测定荧光发射光谱,记录不同芦丁浓度下的荧光强度F(滴定剂累加体积≤65μL,确保体系浓度变化可忽略)。

2、蛋白-核酸相互作用检测(NLRP6-dsRNA体系)

溶液配制:用Tris-HCl缓冲液(pH 7.4)配制2.0×10⁻⁶mol·L¹的NLRP6蛋白溶液和1.0×10⁻⁶mol·L¹的FAM标记dsRNA探针溶液。将dsRNA探针进行2倍梯度稀释,得到16个浓度梯度(1.95×10⁻⁸-1.0×10⁻⁶ mol·L¹)。

FRET检测实验:将不同浓度的dsRNA探针与等体积NLRP6蛋白溶液混合,室温孵育15min,形成反应体系(总体积30μL)。设置博清生物荧光计激发波长为488nm(FAM激发波长),发射波长为520nm(FAM发射波长),测定各反应体系的荧光强度。同时设置未标记dsRNA竞争组(过量未标记dsRNA与FAM标记探针竞争结合NLRP6)和空白对照组(无NLRP6蛋白的探针溶液)。

验证实验:采用EMSA实验验证相互作用,按照常规方法配制PAGE凝胶,将NLRP6蛋白与dsRNA探针孵育后上样电泳,经化学发光成像系统显影分析。

二、结果与分析

(一)博清生物荧光计性能验证

实验前对博清生物荧光计的核心性能进行验证:在488nm激发、520nm发射条件下,对不同浓度的FAM标准溶液进行检测,结果显示荧光强度与FAM浓度在1.0×10⁻⁹-1.0×10⁻⁶mol·L¹范围内呈良好的线性关系(R²=0.9992),最低检测限为3.2×10¹mol·L¹,表明仪器具备高灵敏度;对同一样品进行6次重复检测,相对标准偏差(RSD)为1.2%,证明仪器检测精度优异。此外,仪器的5寸彩色触摸屏操作便捷,程序设置快速,样品台采用抽屉式设计,取放样品高效安全,符合科研实验的高效性需求。

(二)蛋白-小分子相互作用检测结果(BSA-芦丁体系)

1、荧光猝灭光谱特征:在280nm激发下,BSA在341nm处出现强荧光发射峰,对应其分子内色氨酸和酪氨酸残基的内源荧光。随着芦丁浓度的增加,BSA的荧光强度逐渐降低,且荧光发射峰从341nm红移至350nm,表明芦丁与BSA发生了相互作用,导致BSA分子构象改变,疏水腔内的色氨酸残基暴露于极性更强的环境中。

2、猝灭类型与结合参数:根据Stern-Volmer方程拟合得到不同温度(298K、308K)下的K值分别为4.2×10L·mol¹和3.5×10L·mol¹,K随温度升高而降低;计算得到的荧光猝灭速率常数K_q均大于2.0×10¹L·mol¹·s¹(生物大分子动态猝灭的最大K_q值),表明芦丁对BSA的荧光猝灭为静态猝灭,即二者形成了稳定的基态复合物。通过log[(F-F)/F]-log[Q]曲线拟合,得到298K时的结合常数K=2.36×10L·mol¹,结合位点数n=1.02≈1,说明BSA与芦丁之间存在1:1的特异性结合,且结合能力较强。

(三)蛋白-核酸相互作用检测结果(NLRP6-dsRNA体系)

1、FRET检测结果:随着dsRNA探针浓度的增加,NLRP6-dsRNA反应体系的荧光强度逐渐增强,当dsRNA浓度达到8.0×10⁻⁷mol·L¹时,荧光强度趋于稳定,表明反应达到结合平衡。空白对照组荧光强度无明显变化,未标记dsRNA竞争组的荧光强度显著低于同浓度下的实验组,证明NLRP6与dsRNA的结合具有特异性。通过曲线拟合计算得到解离常数K=1.18μM,与文献报道的NLRP6优先结合dsRNA的结果一致。

2、EMSA验证结果:EMSA实验显示,当NLRP6蛋白与FAM标记dsRNA探针孵育后,出现滞后的电泳条带,而未标记dsRNA竞争组的滞后条带强度明显减弱,空白对照组无滞后条带,进一步证实NLRP6与dsRNA存在特异性相互作用,与博清生物荧光计的检测结果相互印证,说明该荧光计检测数据可靠。

三、讨论

生物分子相互作用的精准检测依赖于高性能的检测设备。本研究通过两个经典的生物分子相互作用模型,系统验证了博清生物荧光计的应用效能。在蛋白-小分子相互作用检测中,该仪器成功捕捉到芦丁对BSA的静态荧光猝灭过程,准确测定了结合常数和结合位点数,其检测灵敏度可满足低浓度生物样品的分析需求;在蛋白-核酸相互作用检测中,借助FRET技术实现了NLRP6与dsRNA结合过程的定量分析,解离常数测定结果与EMSA验证结果相符,证明仪器具备良好的准确性。

与传统的荧光检测设备相比,博清生物科技(南京)有限公司研发的荧光计具有显著优势:其一,样品用量仅需1-20μL,可有效减少珍贵生物样品(如纯化蛋白、稀有核酸)的消耗;其二,集成化光路设计支持多通道检测,可兼容多种荧光标记探针,适用于不同类型的生物分子相互作用检测;其三,精准的控温系统和智能分析软件简化了实验操作流程,缩短了实验周期,提高了科研效率。此外,仪器的抽屉式样品台设计提升了操作安全性,5寸触摸屏便于实验参数设置和数据查看,更符合科研人员的实际操作需求。

本研究也存在一定局限性,如未探讨pH、离子强度等环境因素对检测结果的影响,后续可进一步优化实验条件,扩大仪器的应用范围。同时,博清生物荧光计还可结合荧光偏振、荧光寿命等检测模式,实现对生物分子相互作用机制的更深入解析。

本研究建立了基于博清生物荧光计的蛋白-小分子/核酸相互作用检测方法,通过BSA-芦丁和NLRP6-dsRNA两个模型的验证,证实该仪器可准确、高效地完成生物分子相互作用的定性与定量分析,具备高灵敏度、高准确性和操作便捷性的特点。该仪器可广泛应用于药物研发、分子生物学、生物化学等领域的相关科研工作,为生物分子相互作用研究提供可靠的技术支撑。